От Европейската футболна централа (УЕФА) не дадоха лиценз за евротурнирите на четири тима.

Заради неизпълнени финансови и административни условия в Европа през сезон 2008/09 няма да участват ЦСКА (София), Колрейн (Северна Ирландия), Вардар (Скопие) и Земун (Белград, Сърбия). Отделно от това португалският Порто е изваден заради подкупване на съдии в местното първенство през сезон 2003/2004 година.

От полския Гроклин, който завърши на 3-о място в първенството, не подаде изобщо документи за участие в УЕФА, тъй като им предстои обединение с отбора на Шльонск (Вроцлав). Pъководството е преценило, че е прекалено сложно за тях да финализиран обединението и да представят изрядни документи и на двата клуба в УЕФА, затова са решили да се откажат предварително.

Кипърският Аполон (Лимасол) пък се отказа от участие в турнира Интертото и мястото им е заето от Етникос (Ахна). Етникос ще играе с албанския Беса (Кавая) в 1-ия кръг и при победа среща Грасхопър (Швейцария).