Щафетата трябваше да тръгне от пристанището и да финишира на площад Джъстин Херман. Това обаче бе променено в последния момент, след като органите на реда прецениха, че може да се стигне до инциденти.
След запалването на огъня факлоносците бяха откарани тайно с автобус в друга далечна част на града. Там факелното шествие премина при почти празни улици, но в същото време под засилена полицейска охрана, която включваше и представители на китайските специални служби, облечени в спортни екипи.
Освен че бе променен, маршрутът, по който бе пренесен олимпийският огън, бе намален и наполовина в сравнение с първоначално предвидените 10 километра.
Говорителят на факелното шествие Дейвид Пери защити промяната в маршрута. "Извънредните мерки и промените бяха направени за защита на факлоносците", заяви Пери. След инцидентите в Лондон и Париж много от факлоносците вече се страхуват от това върху тях да не бъде оказано насилие от демонстрантите.
Така след два часа игра на котка с мишка щафетата с олимпийския огън в Сан Франциско приключи и се отправи към следващата си спирка - Буенос Айрес.
Сан Франциско бе шестата международна спирка по пътя на олимпийския огън към Пекин'2008 и единствената на северноамериканска земя.
